Неорганическая
Органическая
Коллоидная
Биологическая
Биохимия
Токсикологическая
Экологическая
Химическая энциклопедия
Советская энциклопедия
Справочник по веществам
Гетероциклы
Теплотехника
Углеводы
Квантовая химия
Моделирование ХТС
Номенклатура
Таблица Менделеева
Неорганические реакции
Органические реакции
Молярные массы
Форматирование формул
Редактор формул
Уравнивание реакций
Электронное строение атомов
Игра «Таблица Менделеева»
Термодинамические свойства
Конвертер величин
Гальванопара
Поиск репетиторов
Форум
Лекарства
Фармацевтика
Термины биохимии
Коды загрязняющих веществ
Стандартизация
Каталог предприятий


Следующая Содержание Предыдущая

Молекулярные модели ДНК и тРНК

На схеме представлены вандерваальсовые модели (см. с. 14) двух небольших нуклеиновых кислот. На схеме А изображена ДНК (DNA), построенная из 17 пар нуклеотидов, на схеме Б — структура фенилаланинспецифичной тРНК (tRNA) дрожжей (75 нуклеотидов).

B-ДНК; Phe-тРНК;

А. В-ДНК

При исследовании синтетических молекул ДНК было показано, что ДНК может принимать различные конформации. Наиболее часто встречается приведенная здесь В-форма ДНК. Как отмечалось на с. 90, молекула состоит из двух антипараллельных полидезоксинуклеотидных цепей, которые закручены в правую двойную спираль.

Остов этого тяжа образован остатками дезоксирибозы и фосфатными группировками, соединенными фосфодиэфирными связями. Остов одной цепи выделен темно-синим цветом, другой — синим, а основания обеих цепей — голубым. Ароматические кольца отстоят друг от друга на 0,34 нм и почти перпендикулярны оси спирали. Каждое основание повернуто по отношению к предыдущему на 35о. На каждый виток двойной спирали (360о) приходится примерно 10 пар оснований, ход спирали — 3,4 нм. Между остовами двух отдельных цепей имеются две широкие бороздки. Большая бороздка видна на модели снизу и сверху, малая бороздка — в центре. ДНК-ассоциированные белки (см. сс. 120, 366) взаимодействуют с наиболее доступными основаниями в области большой бороздки. Пространственные соотношения между остовом и основаниями более наглядно видны на модели одинарной цепи (справа). На всех моделях аденин окрашен в желтый цвет, а комплементарный ему тимин — в оранжевый. На виде сверху (в центре; одна цепь выше другой) основания просматриваются наиболее полно.

В определенных условиях ДНК может принимать А-конформацию (на схеме не приведена). При таком расположении сохраняется правая двойная спираль, однако в отличие от B-формы основания уже не перпендикулярны оси, а находятся под другим углом. В Z-конформации (на схеме не приведена), которая может образовываться в участках В-ДНК, богатых GC, расположение нуклеотидов совершенно иное: двойная спираль скручена влево, а остов имеет характерную зигзагообразную форму (отсюда Z-конформация, или Z-ДНК).

Б. Рhе-тРНКРhе

Молекулы РНК не могут образовывать двойную спираль и поэтому не столь высокоупорядочены по сравнению c ДНК. В качестве примера здесь приведена молекула тРНК из дрожжей. Нуклеотидная последовательность этой тРНК и общие принципы строения тРНК обсуждались ранее (см. с. 88). По аналогии с другими моделями, приведенными на схеме А, основания окрашены в голубой цвет, остов из остатков рибозы и фосфатных группировок — в темно-синий. Связанная на 3'-конце молекула фенилаланина выделена красным цветом (в исследованной тРНК этот аминокислотный остаток отсутствовал).

На модели видно, что тРНК свернута в компактную клинообразную структуру. Как и в ДНК, большинство основании находятся внутри молекулы, в то время как полярный остов — на поверхности. Исключение составляют три основания антикодона (окрашены в желтый цвет), который должен взаимодействовать с мРНК. Большинство оснований принимает участие в межмолекулярном спаривании. Как показано на с. 88, некоторые из образованных пар не соответствуют общим принципам спаривания оснований, обычно соблюдаемым в ДНК (A + U, G + С).

Следующая Содержание Предыдущая


     © ХиМиК.ру




Реклама   Обратная связь   Дизайн